BIOS3000 ¨C Design og analyse av biologiske studier

Kort om emnet

Emnet gir en grundig innf?ring i viktige aspekter rundt design av biologiske studier og statistisk analyse i biologi. Det legges vekt p? bruk av statistiske modeller for ? kunne trekke slutninger om biologiske m?nstre og prosesser. Gjennom prosjektarbeid, regne?velser og data?velser f?r du grunnleggende ferdigheter i moderne biologisk forskning. Det statistiske programmeringsmilj?et R benyttes gjennom hele kurset.

Hva l?rer du?

Etter ? ha fullf?rt emnet forventes du ha f?lgende kompetanse:

• Forst? forskjellen mellom observasjonsstudier og eksperimenter, og kunne vurdere resultater fra ulike typer studier i en biologisk sammenheng.
• Forst? betydningen av begrepene pseudoreplikasjon, sammenblanding (konfundering), eksperimentell kontroll, randomisering, sampling skjevhet, stratifisert sampling og blokking i sammenheng med planlegging og analyse av biologiske studier.
• Kunne utf?re Monte Carlo-simuleringer for ? vurdere ulike studiedesigner og statistiske modeller.
• Kunne tilpasse biologisk relevante modeller basert p? normalfordeling, binomisk fordeling og Poisson-fordeling (GLM), og kunne beregne line?re kontraster og prediksjoner med konfidensintervaller fra disse tilpasningene, samt ? kunne vurdere hvor godt disse modellene passer til data.
• Kunne tilpasse hierarkiske modeller med normalfordelte responsvariabler og tolke disse.
• Kunne vurdere kilder til forventningsskjevhet i modeller som tilpasses biologiske data, herunder effekter av sampling skjevhet, m?lefeil i forklaringsvariabler (attenuasjon) og frafall av studieenheter gjennom studiets forl?p.
• Ha kjennskap til vanlige tankefeil i tolkning av statistiske analyser.
• Ha kjennskap til prinsipper for valg av modell som er best egnet for ? besvare spesifikke forskningssp?rsm?l.
• Kunne presentere (p? Engelsk) vitenskapelige resultater av biologiske studier skriftlig og muntlig, samt ha erfaring fra Å·ÖÞ±­ÔÚÏßÂòÇò_Å·ÖÞ±­Í¶×¢ÍøÕ¾ÍƼö@ med medstudenter og vitenskapelig ansatte i forskningsprosjekter

Opptak til emnet

Prioritet vil bli gitt til studenter p? bachelorprogrammet i biovitenskap.

Spesielle opptakskrav

I tillegg til?generell studiekompetanse?eller?realkompetanse?m? du dekke spesielle opptakskrav.

Du m? ha:

• Matematikk R1 (eller Matematikk S1 + S2)

Og en av disse:

• Matematikk R2
• Fysikk (1+2)
• Kjemi (1+2)
• Biologi (1+2)
• Informasjonsteknologi (1+2)
• Geofag (1+2)
• Teknologi og forskingsl?re (1+2)

Matematikk R2 var et krav til og med studie?ret 2021/2022 som del av en fors?ksordning. Fra og med studie?ret 2022/2023 er det ikke lenger et krav med matematikk R2.

De spesielle opptakskravene kan ogs? dekkes med fag fra videreg?ende oppl?ring f?r Kunnskapsl?ftet, eller p? andre m?ter.?Les mer om spesielle opptakskrav.

Obligatoriske forkunnskaper

STK1000 ¨C Innf?ring i anvendt statistikk eller tilsvarende.

Anbefalte forkunnskaper

Element?re forkunnskaper i programmering tilsvarende innholdet i BIOS1100 ¨C Innf?ring i beregningsmodeller for biovitenskap er sterkt anbefalt.

Andre anbefalte forkunnskaper er?BIOS1110 ¨C Celle- og molekyl?rbiologi, BIOS1120 ¨C Fysiologi, BIOS1140 ¨C Evolusjon og genetikk og BIOS2100 ¨C Generell ?kologi.

Overlappende emner

• 10 studiepoeng overlapp med BIOS4000 ¨C Design og analyse av biologiske studier.
• 10 studiepoeng overlapp med BIO2150 ¨C Biostatistikk og studiedesign (nedlagt).
• 10 studiepoeng overlapp med BIO2130 ¨C Biostatistikk (nedlagt).
• 10 studiepoeng overlapp med BIO2110 ¨C Eksperimentell ?kologi (nedlagt).

Undervisning

Emnet best?r av:

• Forelesninger

• Oppgave-l?sning med veiledning

• Obligatoriske innleveringer

• Et obligatorisk gruppeprosjekt med utarbeidelse av en muntlig presentasjon i grupper

Alt kursmateriell er p? engelsk og alle rapporter m? skrives p? engelsk. Alle obligatoriske aktiviteter m? v?re godkjente for ? kunne g? opp til eksamen. Det er obligatorisk oppm?te til f?rste forelesning for studenter som skal f?lge undervisning i emnet. Dette gjelder ogs? for studenter p? venteliste. Du mister plassen p? emnet dersom?forfall til f?rste forelesning ikke er meldt til studieinfo@ibv.uio.no , f?r forelesningen starter. Godkjente obligatoriske aktiviteter?er gyldige i 3??r.

Adgang til undervisning: Dersom du har?gjennomf?rt og f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav p? ny undervisning. Dersom du har f?tt undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomf?rt eller f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du?rett til ny undervisning n?r det er ledig?kapasitet.

Eksamen

Avsluttende skriftlig eksamen som teller 100% av karakteren.

Alle obligatoriske aktiviteter?m? v?re godkjente for ? kunne g? opp til eksamen.?

Som eksamensfors?k i dette emnet teller ogs? fors?k i f?lgende tilsvarende emner: BIOS4000 ¨C Design og analyse av biologiske studier, BIO2150 ¨C Biostatistikk og studiedesign (nedlagt), BIO2130 ¨C Biostatistikk (nedlagt), BIO2110 ¨C Eksperimentell ?kologi (nedlagt)

Hjelpemidler til eksamen

Ingen hjelpemiddel tillatt. Kalkulator vil v?re tilgjengelig i Inspera under eksamen.

Eksamensspr?k

Du kan besvare eksamen p? norsk, svensk, dansk eller engelsk.

Karakterskala

Emnet bruker?karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.

Adgang til ny eller utsatt eksamen

Studenter som dokumenterer gyldig frav?r fra ordin?r eksamen, kan ta?utsatt eksamen i starten av neste semester.

Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordin?r eksamen, eller som ikke har best?tt.

Mer om eksamen ved UiO

• Kildebruk og referanser
• Tilrettelegging p? eksamen
• Trekk fra eksamen
• Syk p? eksamen / utsatt eksamen
• Begrunnelse og klage
• Ta eksamen p? nytt
• Fusk/fors?k p? fusk

Andre veiledninger og ressurser finner du p? fellessiden om eksamen ved UiO.